MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome I

Total Repeats: 55388

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012578	AT	4	8	12	19	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012578	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012578	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012578	CTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012578	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012578	TTGA	2	8	269	276	25 %	50 %	25 %	0 %	227080238
7	NC_012578	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	227080238
8	NC_012578	T	6	6	292	297	0 %	100 %	0 %	0 %	227080238
9	NC_012578	A	8	8	325	332	100 %	0 %	0 %	0 %	227080238
10	NC_012578	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080238
11	NC_012578	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080238
12	NC_012578	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080239
13	NC_012578	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080239
14	NC_012578	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080239
15	NC_012578	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080239
16	NC_012578	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080239
17	NC_012578	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
18	NC_012578	A	6	6	839	844	100 %	0 %	0 %	0 %	227080240
19	NC_012578	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080240
20	NC_012578	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080240
21	NC_012578	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	227080240
22	NC_012578	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080240
23	NC_012578	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080240
24	NC_012578	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080240
25	NC_012578	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080240
26	NC_012578	GC	3	6	1315	1320	0 %	0 %	50 %	50 %	227080240
27	NC_012578	T	6	6	1331	1336	0 %	100 %	0 %	0 %	227080240
28	NC_012578	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
29	NC_012578	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080240
30	NC_012578	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
31	NC_012578	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	227080240
32	NC_012578	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080240
33	NC_012578	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080240
34	NC_012578	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
35	NC_012578	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	227080240
36	NC_012578	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080240
37	NC_012578	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080240
38	NC_012578	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	227080240
39	NC_012578	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	227080240
40	NC_012578	AAT	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080240
41	NC_012578	ACC	2	6	2127	2132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080240
42	NC_012578	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080240
43	NC_012578	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012578	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012578	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012578	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012578	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	227080241
48	NC_012578	T	6	6	2289	2294	0 %	100 %	0 %	0 %	227080241
49	NC_012578	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
50	NC_012578	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080241
51	NC_012578	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
52	NC_012578	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
53	NC_012578	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
54	NC_012578	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
55	NC_012578	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
56	NC_012578	CTTTCT	2	12	2654	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
57	NC_012578	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
58	NC_012578	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
59	NC_012578	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
60	NC_012578	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
61	NC_012578	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
62	NC_012578	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080241
63	NC_012578	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	227080241
64	NC_012578	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	227080241
65	NC_012578	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
66	NC_012578	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	227080241
67	NC_012578	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
68	NC_012578	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
69	NC_012578	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080241
70	NC_012578	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080241
71	NC_012578	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080241
72	NC_012578	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
73	NC_012578	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
74	NC_012578	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080241
75	NC_012578	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080241
76	NC_012578	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	227080241
77	NC_012578	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
78	NC_012578	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	227080241
79	NC_012578	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080241
80	NC_012578	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080241
81	NC_012578	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080241
82	NC_012578	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080241
83	NC_012578	AGGAGC	2	12	3759	3770	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	227080241
84	NC_012578	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080241
85	NC_012578	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080241
86	NC_012578	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080241
87	NC_012578	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	227080241
88	NC_012578	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	227080242
89	NC_012578	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080242
90	NC_012578	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227080242
91	NC_012578	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080242
92	NC_012578	GA	3	6	4140	4145	50 %	0 %	50 %	0 %	227080242
93	NC_012578	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	227080243
94	NC_012578	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080243
95	NC_012578	GC	3	6	4200	4205	0 %	0 %	50 %	50 %	227080243
96	NC_012578	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080243
97	NC_012578	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080243
98	NC_012578	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	227080243
99	NC_012578	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227080243
100	NC_012578	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	227080243
101	NC_012578	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012578	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080244
103	NC_012578	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080244
104	NC_012578	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080244
105	NC_012578	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012578	GACGCC	2	12	4702	4713	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
107	NC_012578	CAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012578	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012578	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	227080245
110	NC_012578	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080245
111	NC_012578	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080245
112	NC_012578	T	6	6	5057	5062	0 %	100 %	0 %	0 %	227080245
113	NC_012578	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	227080245
114	NC_012578	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080245
115	NC_012578	CG	3	6	5150	5155	0 %	0 %	50 %	50 %	227080245
116	NC_012578	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080245
117	NC_012578	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227080245
118	NC_012578	AG	3	6	5186	5191	50 %	0 %	50 %	0 %	227080245
119	NC_012578	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080245
120	NC_012578	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
121	NC_012578	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	227080245
122	NC_012578	CG	3	6	5316	5321	0 %	0 %	50 %	50 %	227080245
123	NC_012578	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
124	NC_012578	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	227080245
125	NC_012578	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080245
126	NC_012578	TC	3	6	5524	5529	0 %	50 %	0 %	50 %	227080245
127	NC_012578	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080245
128	NC_012578	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	227080246
129	NC_012578	ACC	3	9	5669	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227080246
130	NC_012578	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080246
131	NC_012578	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	227080246
132	NC_012578	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	227080246
133	NC_012578	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	227080246
134	NC_012578	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080246
135	NC_012578	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080246
136	NC_012578	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	227080246
137	NC_012578	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080246
138	NC_012578	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080246
139	NC_012578	A	6	6	6092	6097	100 %	0 %	0 %	0 %	227080246
140	NC_012578	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080246
141	NC_012578	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_012578	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012578	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080247
144	NC_012578	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080247
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146	NC_012578	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	227080247
147	NC_012578	CA	3	6	6946	6951	50 %	0 %	0 %	50 %	227080247
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149	NC_012578	TG	3	6	7101	7106	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_012578	AGT	2	6	7166	7171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012578	ATCAAA	2	12	7187	7198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_012578	ACT	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_012578	TG	3	6	7264	7269	0 %	50 %	50 %	0 %	227080248
154	NC_012578	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227080248
155	NC_012578	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227080248
156	NC_012578	TGAG	2	8	7398	7405	25 %	25 %	50 %	0 %	227080249
157	NC_012578	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227080249
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170	NC_012578	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080249
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173	NC_012578	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227080249
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199	NC_012578	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080249
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201	NC_012578	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080249
202	NC_012578	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_012578	GA	3	6	11090	11095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_012578	GAA	2	6	12014	12019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080252
261	NC_012578	TGA	2	6	12041	12046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227080252
262	NC_012578	CCAAA	2	10	12107	12116	60 %	0 %	0 %	40 %	227080252
263	NC_012578	TTC	2	6	12128	12133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227080252
264	NC_012578	ATGA	2	8	12162	12169	50 %	25 %	25 %	0 %	227080252
265	NC_012578	AAGCG	2	10	12200	12209	40 %	0 %	40 %	20 %	227080252
266	NC_012578	ATT	2	6	12228	12233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227080252
267	NC_012578	GCG	2	6	12237	12242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080252
268	NC_012578	GCG	2	6	12255	12260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227080252
269	NC_012578	GC	3	6	12292	12297	0 %	0 %	50 %	50 %	227080252
270	NC_012578	GCGG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	75 %	25 %	227080252
271	NC_012578	CCGTAA	2	12	12410	12421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	227080252
272	NC_012578	TGT	2	6	12487	12492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227080252
273	NC_012578	AAG	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227080252
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276	NC_012578	CAT	4	12	12581	12592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227080252
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289	NC_012578	TTGA	2	8	13203	13210	25 %	50 %	25 %	0 %	227080252
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